Die erste Maschine (U-2001) traf am 2. April 1964 in Emmen ein. Dieses als erste Schweizer Mirage gelieferte Flugzeug wurde 1990 im EIDG. FLUGZEUGWERK EMMEN (F+W) einer weitgehenden Modernisierung unterzogen und unter anderem mit Canards, Nasenstrakes und einer neuen Cockpithaube ausgerüstet. Da der Doppelsitzer danach mit AIM-9 Side-winder-Lenkwaffen bestückt werden konnte, erhielt er auch die neue Nummer J-2001.